Não dá para excluir
Embora o Threads tenha prometido que vá mudar essa configuração no futuro, no momento não é possível excluir sua conta no Threads sem excluir o Instagram junto. Por isso, se você já cansou da rede social nesses primeiros 10 dias após o lançamento mas não quer deletar o Instagram, a solução é desativar o Threads e excluir o aplicativo.